Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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