Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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