Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms