Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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