Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FCAR-202ENST00000353758 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MIR1269A-201ENST00000408636 105 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HSD3BP4-201ENST00000511509 1120 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 IGLV1-41-201ENST00000519790 406 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC092681.2-201ENST00000565102 3044 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SKP241-201ENST00000464584 291 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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