Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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