Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GTF3C6Q969F1 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms