Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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