Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFTN1Q14699 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms