Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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LMOD1P29536 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LMOD1P29536 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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