Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms