Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms