Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WASHC2CQ9Y4E1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WASHC2CQ9Y4E1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms