Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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HCN4Q9Y3Q4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HCN4Q9Y3Q4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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