Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms