Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms