Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCG2Q9UNQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG2Q9UNQ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms