Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms