Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms