Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFDP1Q9UEE9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms