Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK4Q9UBT3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms