Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIPA1L2Q9P2F8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIPA1L2Q9P2F8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms