Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms