Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms