Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms