Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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