Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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