Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSD3Q9NYI0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms