Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms