Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms