Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms