Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms