Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms