Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPOLBQ9NRJ5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms