Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms