Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms