Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRABDQ9H4I3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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