Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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