Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms