Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB1BQ9H0U4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms