Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms