Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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