Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRNKL1Q9BZJ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms