Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms