Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC106Q9BWC9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC106Q9BWC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms