Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms