Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP23Q9BRU9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP23Q9BRU9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms