Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms