Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3CQ99613 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms