Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP2Q96SN8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms